一、明确了合伙企业征税范围范围
合伙企业是指依照中国法律、行政法规成立的合伙企业。在2006年8月28日新修订的《中华人民共和国合伙企业法》中，规定合伙企业有三种形式：普通合伙，特殊的普通合伙以及有限合伙。并规定自然人、法人和其他组织可以成为合伙人，明确法人和其他组织享有合伙人资格。根据财政部、国家税务总局《关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定》（财税[2000]91号）中，合伙企业是指依照《中华人民共和国合伙企业法》登记成立的合伙企业；依照《中华人民共和国私营企业暂行条例》登记成立的合伙性质的私营企业；依照《中华人民共和国律师法》登记成立的合伙制律师事务所；经政府有关部门依照法律法规批准成立的负无限责任和无限连带责任的其他个人独资、个人合伙性质的机构或组织。另外《中华人民共和国企业所得税法》第一条在中华人民共和国境内，企业和其他取得收入的组织（以下统称企业）为企业所得税的纳税人，依照本法的规定缴纳企业所得税。个人独资企业、合伙企业不适用本法。合伙企业应缴纳个人所得税，修订后的《合伙企业法》增加了有限合伙人，合伙企业中的有限合伙人如何交所得税就需要明确。《关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定》（财税[2000]91号）规定本通知所称合伙企业是指依照中国法律、行政法规成立的合伙企业。合伙企业以每一个合伙人为纳税义务人。合伙企业合伙人是自然人的，缴纳个人所得税；合伙人是法人和其他组织的，缴纳企业所得税。对前面提到的问题有效解决。
二、 应纳税所得额的计算
《关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定》（财税[2000]91号）明确规定合伙企业生产经营所得和其他所得采取“先分后税”的原则。具体应纳税所得额的计算按照《财政部、国家税务总局关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定》（财税[2000]91号）及《财政部、国家税务总局关于调整个体工商户个人独资企业和合伙企业个人所得税税前扣除标准有关问题的通知》（财税[2008]65号）的有关规定执行。前款所称生产经营所得和其他所得，包括合伙企业分配给所有合伙人的所得和企业当年留存的所得（利润）。财税[2000]91号文件规定，个人独资企业、合伙企业比照个体工商户缴纳个人所得税。合伙企业每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，作为投资者个人的生产经营所得。财税[2008]65号文件规定，对合伙企业投资者的生产经营所得依法计征个人所得税时，合伙企业投资者本人的费用扣除标准统一确定为24000元/年（2000元/月）。上述标准从2008年3月1日起执行。另外，投资者的工资不得在税前扣除，投资者兴办两个或两个以上企业的，其准予扣除的个人费用，由投资者选择在其中一个企业的生产经营所得中扣除；企业向其从业人员实际支付的合理的工资、薪金支出，允许在税前据实扣除；投资者及其家庭发生的生活费用不允许在税前扣除。投资者及其家庭发生的生活费用与企业生产经营费用混合在一起，并且难以划分的，全部视为投资者个人及其家庭发生的生活费用，不允许在税前扣除；企业生产经营和投资者及其家庭生活共用的固定资产，难以划分的，由主管税务机关根据企业的生产经营类型、规模等具体情况，核定准予在税前扣除的折旧费用的数额或比例；企业计提的各种准备金不得扣除；企业拨缴的工会经费、发生的职工福利费、职工教育经费支出分别在工资、薪金总额2%、14%、2.5%的标准内据实扣除；企业每一纳税年度发生的广告费和业务宣传费用不超过当年销售（营业）收入15%的部分，可据实扣除；超过部分，准予在以后纳税年度结转扣除。企业每一纳税年度发生的与其生产经营业务直接相关的业务招待费支出，按照发生额的60%扣除，但最高不得超过当年销售（营业）收入的5‰。上述政策除特别说明外，均从2008年1月1日起执行。
三、明确了合伙企业的合伙人按照下列原则确定应纳税所得额
财税[2000]91号文件规定，合伙企业的投资者按照合伙企业的全部生产经营所得和合伙协议约定的分配比例确定应纳税所得额，合伙协议没有约定分配比例的，以全部生产经营所得和合伙人数量平均计算每个投资者的应纳税所得额。
《关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》（财税[2008]159号），合伙企业的合伙人按照下列原则确定应纳税所得额：
1.合伙企业的合伙人以合伙企业的生产经营所得和其他所得，按照合伙协议约定的分配比例确定应纳税所得额；
2.合伙协议未约定或者约定不明确的，以全部生产经营所得和其他所得，按照合伙人协商决定的分配比例确定应纳税所得额；
3.协商不成的，以全部生产经营所得和其他所得，按照合伙人实缴出资比例确定应纳税所得额；
4.无法确定出资比例的，以全部生产经营所得和其他所得，按照合伙人数量平均计算每个合伙人的应纳税所得额。
还规定，合伙协议不得约定将全部利润分配给部分合伙人。与财税[2000]91号文件相比，《关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》（财税[2008]159号）增加了“协商不成的，以全部生产经营所得和其他所得，按照合伙人实缴出资比例确定应纳税所得额；无法确定出资比例的，以全部生产经营所得和其他所得，按照合伙人数量平均计算每个合伙人的应纳税所得额”这两项原则规定，将更方便实际操作。
四、明确了合伙企业的合伙人计算其缴纳企业所得税的处理
合伙企业的合伙人是法人和其他组织的，合伙人在计算其缴纳企业所得税时，不得用合伙企业的亏损抵减其盈利。
———————————————— 对应法规 ————————————————
《财政部、国家税务总局关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》（财税[2008]159号）
《财政部、国家税务总局关于印发<关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的法规>的通知》（财税[2000]91号）
《财政部、国家税务总局关于调整个体工商户个人独资企业和合伙企业个人所得税税前扣除标准有关问题的通知》（财税[2008]65号）
